Nghi Xuân sơ khai gồm 16 xóm bao gồm:

Xóm Lộc Mỹ ; Xóm Yên Thịnh; Xóm Tân Nghĩa ; Xóm Tiên Lạc; Xóm Xuân Cảnh ; Xóm Xuân Dương; Xóm Xuân Giang ; Xóm Xuân Khánh ; Xóm Xuân Lan ; Xóm Xuân Lộc ; Xóm Xuân Phúc ; Xóm Xuân Sơn ; Xóm Xuân Tân ; Xóm Xuân Tình; Xóm Xuân Trang ; Xóm Xuân Yên.Năm 2002 Tách một phần Xóm Xuân Trang lập 2 xóm mới: Xuân Trang và Phong Hồ. Tách một phần Xóm Xuân Cảnh lập 2 xóm mới: Xuân Cảnh và Vạn Xuân. Theo Nghị quyết HĐND tỉnh Nghệ An khóa XVII (2019) Xã Nghi Xuân sát nhập 17 xóm còn lại 7 Xóm.